Diario di viaggio

Buongiorno a tutti!!

Caricare il sequenziatore è sempre un’esperienza per me! Ogni volta che lo carico con i campioni ci penso tutta la sera e la mattina sono tentata ad albeggiare in laboratorio per vedere se tutto va bene (come stamattina alle 7). Dopo una lunga messa a punto che mi ha permesso di capire come salvare alcune CTC che non sembravano avere una buona qualità, ieri le ho caricate sul MiSeq per capire quale sia lo stato dei loro cromosomi. Per intenderci, metto una figura qui sotto.

I numeri in ascissa da 1 a 22 indicano i cromosomi, mentre in ordinata troviamo il numero di copie di una regione cromosomica. Se la regione è nera, indica che il numero di copie della regione è normale, se rossa ci sono dei gain (quindi più copie) se in blu ci sono dei loss (quindi delle copie in meno di quella regione). Ad esempio: la prima parte del cromosoma 1 ha dei pallini rossi, quindi sembra che ci siano più copie. Invece, il cromosoma 13 che presenta tutti pallini blu, ha presenta delle copie in meno rispetto al normale. Di conseguenza c’è un diverso dosaggio genico e diversa produzione di proteine, tipica del cancro ma diverso in funzione del tipo.

Continuerò in settimana a produrre dati di questo genere perchè sono molto validi ai fini della ricerca e soprattutto nuovi.

Buona giornata a tutti!!

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